จำเป็นต้องปิดด่านอาจไม่มีการแจ้งล่วงหน้า พร้อมโต้ไม่จริงยังไม่มีคำสั่งปิดด่านคลองลึก ส่วนคนไทยในกัมพูชาเริ่มทยอยเดินทางกลับประเทศ
เมื่อเวลา 10.00 น. วันที่ 7 มิ.ย. 68 พ.อ.ชัยณรงค์ กาสี ผบ.ฉก.อรัญประเทศ กกล.บูรพา ได้สั่งการให้ พ.อ.เมธี คำเต็ม ผบ.ชค.ทพ.12 และ ร.ท.สาโรจน์ โยธา ผบ.ร้อย ทพ.1201 จัดกำลังพลออกประชาสัมพันธ์แจ้งเตือนคนไทยที่จะเดินทางออกไปกัมพูชา บริเวณหน้าทางเข้าอาคารผู้โดยสารขาออก ด่าน ตม.อรัญประเทศ จุดผ่านแดนถาวรบ้านคลองลึก อ.อรัญประเทศ จ.สระแก้ว เพื่อประชาสัมพันธ์แจ้งเตือนคนไทยหากไม่มีความจำเป็นไม่ควรเดินทางออกไปกัมพูชา เพื่อความปลอดภัยเนื่องจากสถานการณ์ปัจจุบันในกัมพูชามีกระแสต่อต้านประเทศไทยจากกรณีข้อพิพาทชายแดนที่ช่องบก อ.น้ำยืน จ.อุบลราชธานี โดยมีการใช้สื่อโซเชียลโจมตีประเทศไทยและยุยงปลุกปั่นให้เกิดการเกลียดชังและการเผชิญหน้าของทหารไทยและกัมพูชา จึงมาประชาสัมพันธ์แจ้งเตือนคนไทยแต่ถ้าหากจำเป็นต้องเกิดการปิดด่านพรมแดนขอให้คนไทยที่ติดค้างในกัมพูชาอยู่ในที่ปลอดภัยแล้วติดต่อสถานทูตทันที

ต่อมาช่วงสายวันเดียวกัน สถานกงสุลใหญ่กัมพูชาประจำ จ.สระแก้ว ได้ทำหนังสือถึงรองนายกรัฐมนตรี รัฐมนตรีว่าการกระทรวงต่างประเทศกัมพูชา เพื่อรายงานสถานการณ์ชายแดนไทย-กัมพูชา ที่ด่านพรมแดนคลองลึก จุดผ่านแดนถาวรบ้านคลองลึก อ.อรัญประเทศ จ.สระแก้ว ว่าได้ข้อมูลจากทหารไทยที่ประจำอยู่ชายแดน จ.สระแก้ว ว่า ตั้งแต่วันที่ 7 มิ.ย. 68 เป็นต้นไป ด่านตรวจและการเดินทางชายแดนไทย-กัมพูชา (ด่านพรมแดนคลองลึก) ได้ถูกสั่งปิดชั่วคราว (ฝ่ายเดียว) เพื่อรอการเจรจากับฝ่ายกัมพูชา และด่านพรมแดนในจังหวัดต่าง ๆ จะทยอยปิดต่อไป

ซึ่งจากหนังสือของสถานกงสุลใหญ่กัมพูชา ประจำจังหวัดสระแก้ว ที่รายงานถึงรองนายก และ รมว.ต่างประเทศกัมพูชา นั้น พ.อ.เมธี คำเต็ม ผบ.ชค.ทพ.12 เผยว่าไม่เป็นความจริง ยังไม่มีคำสั่งปิดด่านพรมแดนคลองลึกฯ แต่อย่างใด ยังคงเปิดให้เดินทางได้ตามปกติ คาดว่าเป็นการเข้าใจผิดเนื่องจากวันนี้ เราได้นำกำลังออกประชาสัมพันธ์แจ้งเตือนคนไทยที่จะเดินทางออกไปกัมพูชาเท่านั้น ยืนยัน ณ เวลานี้ยังไม่มีการปิดด่านพรมแดนคลองลึกแต่อย่างใด

ส่วนบรรยากาศบริเวณจุดตรวจร่วม อ.20 ร้อย ทพ.1201 ด่านพรมแดนคลองลึก อ.อรัญประเทศ จ.สระแก้ว พบว่ามีคนไทยที่ทำงานอยู่ในบ่อนกาสิโนฝั่งปอยเปต ประเทศกัมพูชา ต่างทยอยเดินทางกลับประเทศไทยกันมากขึ้น เนื่องจากทางฝั่งกัมพูชาได้มีกระแสข่าวลือจากหนังสือของกงสุลใหญ่กัมพูชา ประจำจังหวัดสระแก้ว ที่รายงานถึงรัฐบาลกัมพูชาว่าทหารไทยจะปิดด่านพรมแดนคลองลึกฯ จึงทำให้คนไทยในกัมพูชากลัวด่านถูกปิดจึงเริ่มทยอยเดินทางกลับเข้าไทย